İzmir tarihinin bir Akdeniz kenti olması perspektifiyle yeniden ele alınması Akdeniz Akademisinin öncelikli alanlarından biridir. Kente bir vizyon geliştirdiğinizde bu vizyonun tarihsel bir derinlik kazanabilmesi için tarihinin yeniden yazılması gerekmektedir. Araştırmalar yaptırılacak, uluslararası toplantılar, çalıştaylar, yarışmalar düzenlenecek, sergiler açılacaktır. İzmir Büyükşehir Belediyesi bu faaliyet için Ahmet Piriştina Kent Müzesiyle birlikte çalışacaktır. Bu faaliyet akademinin yaşamı boyunca sürdüreceği bir işlevi olacaktır.